Por padrão, Quarkus usa a implementação do Jaeger para o OpenTracing. O Jaeger está usando cabeçalhos de propagação “Uber“, que são diferentes dos usados por Spring Sleuth (B3). Mas você pode configurar o Quarkus para usar a propagação B3 para torna-lo compatível com Spring Sleuth com a propriedade:
quarkus.jaeger.propagation=b3
Referência: https://quarkus.io/guides/opentracing#quarkus-jaeger_quarkus.jaeger.propagation
Como fazer o Quarkus identificar os Headers do Spring Sleuth